Фамилия Якушенков образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Якушенков послужило церковное имя Яков. Существует две гипотезы происхождения фамилии Якушенков. По одной из них, эта фамилия образована от мужского имени Яков (в переводе с древнееврейского – «последователь»), точнее, от его просторечной формы Якуш, Якушка. Имя Яков (Иаков) переводится с древнееврейского как «второй по рождению». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Якуш, со временем получил фамилию Якушенков. О точном месте и времени возникновения фамилии Якушенков в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Якушенков представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.