По одной из них, эта фамилия образована от мужского имени Яков (в переводе с древнееврейского – «последователь»), точнее от его просторечной формы Якуш, Якушка. Имя Яков (Иаков) переводится с древнееврейского как «второй по рождению». Веселовского упоминаются: Якушкин Третьяк Григорьевич, 1550 г., Псков; Якушкин Иван Данилович, 1577 г., Коломна; Якушкин Иван Яковлевич, 1606 г. В истории известны несколько дворянских родов Якушкиных. Один из них происходит от шляхтича Федора-Яна Ольговича Якушевского, выехавшего в 1412 к великому князю Василию Васильевичу и наименованному Федором Якушом. Этот род этот записан в VI часть родословной книги Смоленской губернии, герб внесен в IV часть Общего Гербовника. Ветвью этого рода является и другой дворянский род Якушкиных, также записанный по Смоленской губернии. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Якушка, со временем получил фамилию Якушкина.