Основой фамилии Якутина послужило мирское имя Якун. Фамилия Якутина восходит к древнему мужскому имени Якун, произошедшему от скандинавского Hakon. Однако источником фамилии могло стать и каноническое имя Иаков, в просторечии Яков (от древнееврейского «идущий по следу»). Исторически же произошло так, что мирское имя Якун в своих уменьшительных формах пересеклось с именем Яков, отчего и возникли фамилии, подобные этой. Существуют и другие гипотезы происхождения данной фамилии. В ее основу могло лечь тюркское мужское имя Якут, которое переводится как «рубин, яхонт». Подобное имя могли дать долгожданному и безгранично любимому ребенку. Возможно, что фамилия Якутин образована от прозвища Якут, которым обычно наделяли жителя Сибири и Крайнего Севера. В этом случае слово «якут» дословно переводится как «окраинный житель» (от тюркского jaka - «край, ворот, граница, берег»). Из древних источников известен некий Якун Слепой - варяг, носивший на больных глазах шитую золотом повязку («луду»). В русской летописи он упоминается под 1023 г., когда Слепой с дружиной пришел на помощь великому князю Ярославу Мудрому, воевавшему с князем Мстиславом Тмутараканским. В битве при Листвене (в 40 верстах к северо-востоку от Чернигова) союзники потерпели поражение, и Якун, потеряв на поле брани свою «луду», бежал с Ярославом в Новгород. Возможно, что именно этот варяжский военачальник и стал родоначальником фамилии. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Якун, со временем получил фамилию Якутина.