Фамилии Якутова образована от прозвища Якут, которое мог получить якут - выходец из Сибири или с Крайнего Севера. В этом случае слово «якут» дословно переводится как «окраинный житель» (от тюркского jaka - «край, ворот, граница, берег»). По другой версии, данная фамилия ведет свое начало от распространённого у мусульман имени Якут, которое имеет древнегреческое происхождение и означает «яхонт» (то есть «рубин» или «сапфир»). В средневековой медицине яхонт считался камнем, имеющим целебные свойства, а потому существовало убеждение, что человеку, носящему это имя, не страшны болезни. Однако имя Якут могли дать и просто горячо любимому (то есть дорогому, как ценный камень) ребёнку. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Якут, со временем получил фамилию Якутова.