Фамилия Яникина — яркий пример того, как женский вариант фамилии может рассказать о происхождении больше, чем мужской. В русской традиции фамилии на -ин образуются от основ, оканчивающихся на -а или -я. Мужская форма здесь — Яникин, а женская, Яникина, исторически закрепилась как указание на принадлежность к роду: «жена Яникина» или «дочь Яникина».

В основе фамилии лежит имя или прозвище Яника. Это нестандартная, диалектная или разговорная форма. Самый вероятный источник — уменьшительно-ласкательная форма от канонического имени Иоанн (в русском быту — Иван). По той же модели образованы Янишев, Януш, Яников. В некоторых говорах «яника» могло означать упрямого, своенравного человека или, наоборот, ласковое обращение к младшему. Вторая версия, менее распространённая, связывает основу с западнославянским или балтийским влиянием: в польском и чешском Janik — это уменьшительное от Ян (Ян), а суффикс -ик указывает на «маленького Яна».

Географически фамилия тяготеет к северо-западным и центральным областям России, где были сильны новгородские и псковские говоры с их особыми формами личных имён. Встречается она и в среде старообрядцев, которые часто сохраняли архаичные прозвищные формы.

Интересная деталь: фамилия Яникина — редкая, и её носительницы в прошлом, скорее всего, происходили из крестьянской или мещанской среды. Дворянские роды с таким окончанием обычно фиксировались в родословных книгах, а Яникины в них не значатся. Это фамилия, которая прямо говорит о родстве по женской линии: в документах XIX века женщину могли записать как «вдова Яникина» или «Яникина дочь», что делало фамилию не просто родовым именем, а указанием на семейное положение и происхождение.