Фамилия Янкус звучит непривычно для русского уха, и это не случайно: её происхождение — литовское или жемайтское. В основе лежит личное имя Янка — уменьшительная форма от имени Йонас (аналог русского Иван). Суффикс -ус в литовской ономастике — типичное окончание мужских фамилий в именительном падеже (ср. Бараускас, Садаускас). Таким образом, Янкус — это не русифицированная, а исходная литовская форма, которую носитель мог сохранить при переезде в русскоязычную среду или при записи в документах.

В XIX — начале XX века многие литовцы и жемайты переселялись в центральные губернии России, в Сибирь, на Дальний Восток. Фамилия Янкус могла закрепиться в тех местах, где оседали выходцы из Ковенской или Виленской губерний. Встречается она и у потомков литовских ссыльных, и у тех, кто просто сменил место жительства. При этом в самой Литве фамилия Янкус сегодня нередкая, но в России остаётся редкой: носителей можно встретить в Калининградской области, в Москве, а также в некоторых сибирских городах.

Словообразовательная модель проста: основа Янк- + окончание -ус. Никаких русских суффиксов (-ов, -ин) здесь нет, поэтому фамилия не склоняется в мужском роде по правилам русской грамматики (Янкус, Янкуса, Янкусу), а в женском — остаётся неизменяемой. Это сразу выдаёт её балтское происхождение. В польской традиции встречается похожая фамилия Янкус, но там она могла возникнуть от имени Ян (Ян + -ус), но с той же семантикой — «сын Яна» или «маленький Ян».

Исходное имя Янка в Литве было распространённым крестьянским прозвищем, поэтому предки современных носителей Янкус — скорее всего, земледельцы или ремесленники из западных губерний Российской империи. Социальный статус, как правило, невысокий: мещане или государственные крестьяне. В дворянских родословных книгах эта фамилия не фиксируется.

Если ваш предок носил фамилию Янкус, то с высокой вероятностью он был литовцем или жемайтом, а его имя при рождении — Йонас. Фамилия не претерпела русификации, что говорит о сохранении национальной идентичности в семье или о поздней записи (уже в советское время, когда национальные окончания не меняли).