Фамилия Яцишен — одна из тех, что сразу выдают географию своего происхождения. Её основа — имя Яць, сокращённая форма от Яков (древнееврейское Иаков, «держащийся за пяту»). В украинской и белорусской традиции имя Яков превращалось в Яць, Яцко, а от них пошли фамилии с разными суффиксами.

Ключевой элемент здесь — суффикс -ен. Он указывает на западноукраинское или белорусское происхождение. В отличие от великорусских фамилий на -ов/-ев, которые означают «чей-то сын» или «чей-то человек», суффикс -ен в восточнославянских фамилиях (особенно в Гродненской, Волынской, Подольской губерниях) выполнял похожую функцию: Яцишен — «маленький Яць», «сын Яця» или «человек из рода Яця». Такая модель характерна для фамилий на -енко (украинские), но здесь финал -ен, а не -енко, что типично для белорусского ареала и части украинского Полесья.

Встречаются и другие варианты написания: Яцишин, Яцышен, Ятчишен. Разница в суффиксе (-ин, -ен) объясняется местными говорами и тем, как чиновники записывали фамилию в метрических книгах. Корень остаётся неизменным — от имени Яць.

Род занятий первых носителей Яцишен, скорее всего, не отличался от занятий соседей: земледелие, ремесло, мелкая торговля. Фамилия не указывает на дворянское происхождение или принадлежность к духовенству — это крестьянская или мещанская фамилия, каких тысячи на западе Российской империи. Встречается она и сегодня преимущественно в Беларуси, на западе Украины, а также среди потомков эмигрантов в России и дальнем зарубежье.