Основой фамилии Яцышина послужило церковное имя Яцыша. Фамилия Яцышина восходит к имени Яцыша, уменьшительной форме имени Ян. Оно, в свою очередь, является польской формой канонического имени Иоанн (в переводе с древнееврейского – «милость Божия»). Согласно другой гипотезе, фамилия Яцышина связана с диалектным словом «яцко», которое в ярославских говорах означало «яичный пирог или печенье с маслом и яйцами, которые пекутся в черепке, латке». В этом случае, прозвище Яцыша получил либо любитель этой выпечки, либо пекарь. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Яцыша, со временем получил фамилию Яцышина.