Фамилия Юдинков — редкий пример, где суффикс -ов наслоился на уже готовую фамилию на -ин. Обычно такие «двойные» окончания возникали, когда носитель фамилии Юдин переезжал в другую местность, и местный писарь или священник приписывал к ней стандартный для своей территории суффикс -ов. Так из Юдина получался Юдинков. Модель нечастая, но встречается в северных и центральных губерниях, где приказчики могли механически «подгонять» фамилию под привычный шаблон.

Основа фамилии — имя Юда, одна из народных форм канонического имени Иуда. В русской традиции это имя не получило однозначно отрицательного оттенка, который закрепился за ним в европейской культуре. В святцах есть несколько святых с этим именем, в том числе апостол Иуда Фаддей, поэтому имя бытовало в крестьянской и купеческой среде. От него образовались уменьшительные формы: Юда, Юдка, Юдинка. Фамилия Юдинков восходит именно к последней — Юдинка, то есть «маленький Юда» или «сын Юды». Суффикс -к- в основе указывает на ласкательное или обиходное прозвище, которое потом закрепилось как фамилия.

Двойной суффикс — главная особенность Юдинкова. Сравните с однокоренными Юдин, Юдинов, Юдинцев. Первые две — стандартная патронимическая модель («чей сын?» — Юдин, Юдинов). Юдинцев — указание на принадлежность к роду Юдинцевых, то есть потомков Юды по мужской линии. У Юдинкова же прослеживается двухшаговая цепочка: сначала от имени Юда образовали уменьшительное Юдинка (прозвище ребёнка или младшего члена семьи), а затем от него — фамилию по отцу. Такое построение встречается у фамилий вроде Петинков, Васьков, но реже, чем обычные -ов и -ин.

География фамилии узкая. Основные очаги — Рязанская область и юг Нижегородчины. В дореволюционных переписях Юдинковы числились в основном государственными крестьянами, реже — однодворцами. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. Встречаемость низкая: даже в областных центрах фамилия остаётся редкой, что говорит о её локальном происхождении и малой миграции носителей.