Фамилия Юнкин восходит к женскому имени Юна, которое переводится с латинского как «единственная». В основе же фамилии лежит производная форма этого имени — Юнка. Согласно другой версии, фамилия Юнкин образована от мужского крестильного имени Юний (или Иоанн), которое в переводе с древнееврейского означает «милость Божья». Менее вероятно, что эта фамилия происходит от прозвища Юнка, которое ведет свое начало от украинского прилагательного «юний» - «молодой» или «юнка» - «молодая девушка». В результате, потомок женщины, обладающей именем Юна, со временем получил фамилию Юнкин.