Фамилия Юпатина образована от имени Юпат, одной из производных форм крестильного мужского имени Ипатий, которое в переводе с греческого означает «высочайший». Скорее всего, основатель рода Юпатиных был выходцем из рабочей или крестьянской среды. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Юпат, со временем получил фамилию Юпатин.