Фамилия Юстин — один из тех редких случаев, когда русская по форме фамилия восходит не к славянскому, а к латинскому личному имени. В основе лежит имя Юстин (лат. Justinus — «справедливый», «праведный»), которое в православных святцах известно как Иустин. В Западной Европе это имя дало фамилии вроде Джастин или Жюстен, а в России оно прижилось в основном в среде духовенства и образованных слоёв.

Модель образования проста: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»). Юстин — это краткая форма от полного имени Юстин (как Иван — Иванов, Пётр — Петров). То есть фамилия буквально означает «сын Юстина» или «человек из рода Юстина». В отличие от массовых фамилий на -ов, -ин здесь присоединён к основе, оканчивающейся на твёрдый согласный, что грамматически безупречно.

Интересно, что фамилия Юстин могла возникнуть и напрямую от прозвища, без посредства церковного имени. В некоторых говорах «юстин» — искажённое «устин» (от Устин, народной формы имени Иустин). Но в любом случае корень один — латинское justus, «справедливый».

Географически фамилия редкая и не имеет выраженного очага. Встречается в центральных областях России, на Украине и в Беларуси, но везде — единичными семьями. Это типичная фамилия-одиночка, которая не успела размножиться и закрепиться в крестьянской среде, где предпочитали более привычные Устинов или Устюгов.

Сословная принадлежность носителей чаще всего — духовенство или мещанство. Семинаристы нередко получали фамилии по именам святых, и Юстин (Иустин) — один из таких вариантов. Если ваш предок носил эту фамилию в XIX веке, велика вероятность, что он был либо священником, либо выходцем из семьи, получившей фамилию при поступлении в духовное училище.

В написании фамилия устойчива: двойных форм (вроде Юстинов) практически не встречается, что говорит о её позднем и книжном происхождении. Это не крестьянское прозвище, а сознательное имяобразование, зафиксированное в метриках.