Фамилия Юсупкин — яркий пример того, как тюркское имя с арабскими корнями прижилось в русской ономастике, обрастая типично русским суффиксом. В основе лежит мужское имя Юсуп, которое является диалектной формой библейского и коранического имени Юсуф (Иосиф). В тюркских языках, особенно у татар и башкир, имя Юсуп было широко распространено, а в русской среде его адаптировали, добавив фамильный суффикс -ин. Модель образования здесь простая: от имени Юсуп (или его разговорного варианта Юсупка) через притяжательное прилагательное «чей?» — Юсупкин сын, то есть потомок Юсупа.

Интересно, что фамилия Юсупкин, в отличие от более аристократичной княжеской фамилии Юсупов, явно крестьянская или мещанская. Суффикс -ин в русских фамилиях часто указывал на принадлежность к роду человека, чьё имя оканчивалось на -а/-я, и в случае с Юсупкиным мы видим двойную русификацию. Сначала имя Юсуп могло получить уменьшительно-ласкательную форму Юсупка (по аналогии с Ивашка, Петька), а затем от этой формы и образовалась фамилия. Это говорит о том, что предок носителя фамилии был простолюдином, и в быту его называли не полным именем, а именно так, по-домашнему.

Географически фамилия тяготеет к регионам с сильным татарским и башкирским влиянием — Поволжье, Приуралье, а также к бывшим татарским слободам в центральной России. Встречается она нечасто, что делает её довольно редкой. Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Юсупов — это «старший брат» по происхождению, но если Юсуповы могли быть и мурзами, и дворянами, то Юсупкины почти наверняка происходили из крестьян или посадских людей, принявших православие и взявших фамилию по имени отца.

Словообразовательная цепочка проста и прозрачна: арабское Юсуф → тюркское Юсуп → русское прозвище Юсупка → фамилия Юсупкин. Никаких сложных этимологических загадок здесь нет. Спорным может быть только вопрос, от какой именно формы пошла фамилия — напрямую от Юсуп или через уменьшительное Юсупка. Второй вариант правдоподобнее, так как суффикс -ин редко присоединяется к основам на твёрдый согласный (Юсуп + -ов дало бы Юсупов), а вот к основе на -а (Юсупк-а) он присоединяется органично. Таким образом, Юсупкин — это «сын Юсупки», то есть потомок человека, которого в деревне звали ласково, по-свойски.