Фамилия Забобурин — один из тех случаев, когда корень слова уводит нас в диалектную лексику, а не в церковное имя или профессию. Основа здесь — «забобура». В русских говорах, особенно на севере и в Сибири, так называли человека несуразного, нерасторопного, с причудами. Слово «забобуры» (или «забабуры») фиксировали этнографы в значении «странные выходки», «нелепые поступки». Соответственно, Забобура — прозвище для того, кто эти самые забобуры и вытворял: чудил, делал всё невпопад или говорил невпопад.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность. Забобурин — «чей?» — сын Забобуры. Это одна из самых распространённых моделей в северных и центральных областях России, где активно использовали прозвища на -а. Суффикса -ов здесь быть не могло, потому что основа оканчивается на -а, а не на твёрдый согласный.

В словаре Б. О. Унбегауна «Русские фамилии» подобные образования от прозвищ с корнем «за-» и экспрессивной окраской рассматриваются как характерные для простонародной среды крестьян и посадских людей. Фамилия Забобурин — не дворянская и не книжная, она вышла из живой речи, из деревенского обихода. Встречается она редко, и это тоже показатель: прозвище было не самым лестным, и давали его не каждому, а тому, кто действительно выделялся странным поведением.

Если сравнивать с однокоренными, то есть фамилия Забобуров, но она образована по другой модели — от формы Забобур (с нулевым окончанием), что встречается реже. Забобурин же — более архаичный и «северный» вариант. Географически носители фамилии чаще всего встречаются на Урале и в Поволжье, что совпадает с ареалом бытования самого диалектного слова.

Итак, предок носителя фамилии Забобурин, скорее всего, был крестьянином из северных или уральских губерний, получившим прозвище за необычный, чудаковатый нрав. Никакой тайны или знатного происхождения тут нет, зато есть прямая связь с живым народным языком, который почти исчез.