Фамилия Залогина образована от прозвища Залога, а та — от нарицательного слова с несколькими значениями. В одних русских диалектах залогой называли непаханую землю, целину, в других — преграду, заслон. Исходя из этого, прозвище мог получить человек, живший на целине или в труднопроходимой, отгороженной местности.

Есть и другая версия, связанная с корнем «лог» — овраг, ложбина, низменность, иногда луг. Тогда Залогой называли того, кто поселился за логом. Это одна из самых прозрачных моделей русских прозвищ: человек, живущий за каким-то ориентиром, получал имя по этому ориентиру с предлогом «за».

Слово «залога» бытует и в украинском языке, где означает воинский гарнизон, засаду, охрану или вооруженный отряд, скрытно ожидающий врага. Если основатель рода имел отношение к военному делу — нёс сторожевую службу, командовал заставой — прозвище Залога могло закрепиться за ним по этому признаку.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Залог- добавился суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — Залогин, то есть сын или потомок Залоги). Это одна из самых распространённых моделей в северных и центральных регионах России, где фамилии на -ин часто вытесняли южнорусские формы на -ов.

Таким образом, у фамилии Залогина как минимум два правдоподобных объяснения: географическое (по месту жительства за логом или на целине) и профессионально-военное (по службе в заставе или охране). Оба имеют равное право на существование, и без точных сведений о месте происхождения конкретной семьи выбрать между ними невозможно.