Фамилия Занудько — один из ярких примеров украинской модели фамилий, образованных при помощи суффикса -ко. Этот формант в украинской ономастике присоединяли к прозвищам, именам и названиям профессий, придавая им уменьшительно-ласкательный или, чаще, принадлежностный оттенок («чей-то сын», «кто-то из рода такого-то»). В данном случае основа — прозвище Зануда.

Само слово «зануда» в значении «надоедливый, нудный человек» известно в восточнославянских говорах с XVII века. Однако важно понимать: в ту эпоху прозвища редко были прямой характеристикой в современном бытовом смысле. Скорее всего, Занудой называли не просто нудного человека, а того, кто отличался настойчивостью, дотошностью, склонностью кропотливо вникать в детали или надоедать просьбами. Такое прозвище мог получить ремесленник, требующий точности, или крестьянин, который дотошно выяснял отношения при дележе земли. В некоторых говорах слово «зануда» имело и более нейтральные оттенки — «плакса» или «нытик», но это уже региональные варианты.

Фамилия Занудько закреплена преимущественно в центральных и восточных областях Украины, особенно в Черкасской, Полтавской и Киевской. Встречается она и в южных регионах России, куда попала с переселенцами в XIX–XX веках. Суффикс -ко в украинской среде чаще всего указывал на происхождение из казацкой или крестьянской среды, а не из шляхты (у которой преобладали фамилии на -ский). Поэтому предки носителей фамилии Занудько, скорее всего, были свободными крестьянами или казаками, получившими прозвище по своей манере поведения.

Интересно, что фамилия не получила распространения в белорусской или польской традиции, где аналогичные прозвища оформлялись бы иначе (например, Занудович или Занудский). Это подчёркивает её сугубо украинское происхождение. В современных списках фамилия Занудько встречается нечасто, что делает её довольно редкой и сохранившей первоначальную прозвищную основу без поздних русификаций.