Фамилия Заубер — редкий для России случай, когда немецкая фамилия сохранила исходное написание и звучание почти без изменений. Её основа — немецкое прилагательное sauber, что значит «чистый», «опрятный», «аккуратный». В отличие от многих немецких фамилий, образованных от профессий или местности, Заубер — это прозвище по личному качеству. Так могли назвать человека, который следил за собой, за своим домом или рабочей одеждой, то есть чистюлю и педанта. В русской среде такая фамилия почти не встречается, и её носители — это, как правило, потомки немцев, переселившихся в Российскую империю.

Исторический контекст появления фамилии Заубер в России связан с несколькими волнами иммиграции. Первая и самая массовая — приглашение Екатериной II немецких колонистов во второй половине XVIII века. Они селились компактно в Поволжье, Причерноморье и на Волыни. Фамилия Заубер могла быть принесена именно тогда. Вторая волна — специалисты, приезжавшие по контракту в XIX веке: инженеры, врачи, управляющие имениями. В любом случае, фамилия указывает на немецкое происхождение, и её носители были скорее всего горожанами или ремесленниками, а не крестьянами, так как прозвище «чистый» чаще давали людям, не занятым ежедневным грязным трудом в поле.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: фамилия образована напрямую от прилагательного без дополнительных суффиксов. Это типично для немецких фамилий, которые часто представляют собой застывшее прозвище. В русской традиции, если бы фамилию адаптировали, она могла бы звучать как Зауберов или Зауберский, но этого не произошло — её оставили в оригинале. Интересно, что в немецком языке слово sauber имеет и переносное значение: «честный», «порядочный». Поэтому нельзя исключать, что прозвище относилось не только к внешней опрятности, но и к моральным качествам человека.

Географически в России фамилия Заубер встречается крайне редко. Единичные носители зафиксированы в крупных городах (Москва, Санкт-Петербург) и в регионах исторического расселения немцев — в Омской, Новосибирской областях и Алтайском крае, куда немцев выселяли в годы войны. За пределами России фамилия обычна в Германии, Австрии и Швейцарии. Известных носителей фамилии, вошедших в общероссийские энциклопедии, нет, что лишь подтверждает её редкость и локальный характер бытования.