Фамилия Жагора — редкая и звучная, её происхождение не лежит на поверхности. В отличие от множества фамилий на -ов и -ин, она сохранила почти неизменной форму прозвища или имени, от которого образована. Скорее всего, перед нами украинская или белорусская фамилия, о чём говорит конечное ударение и характерный для этих регионов тип образования без суффикса.

В основе лежит слово «жагора» — диалектный вариант «жара», «зной» или «горячка». В юго-западных говорах так могли назвать человека с горячим, вспыльчивым нравом — «жаркого» в переносном смысле. Есть и другая, более конкретная версия: в польском и украинском языках «żagor» или «жагор» означало «уголь», «головешка» или «тлеющее полено». Прозвище Жагора могли дать либо тому, кто работал с углём (углежогу, кузнецу), либо человеку со смуглой, «обгоревшей» кожей.

Менее вероятно, но возможно, что фамилия восходит к личному имени Жагора — производной форме от канонического имени Егор или Георгий. В народной среде такие сокращения, как Жора, Жага, были обычны, и Жагора могла стать их полной формой, закрепившейся в качестве фамилии.

Географически фамилия тяготеет к западным областям России, а также к Украине и Беларуси. В документах XIX века Жагоры встречаются среди мещан и крестьян Могилёвской и Витебской губерний. В современной России фамилия остаётся малочисленной, что говорит о её локальном происхождении — она не разошлась широко, а закрепилась в конкретных сёлах и местечках.

Интересна словообразовательная модель: отсутствие суффикса (так называемая «нулевая» суффиксация) характерна для прозвищ, которые перешли в фамилии без изменений. Это делает Жагору «живым» свидетельством того, как в прошлом человека могли назвать одним ёмким словом, описывающим его характер или занятие.