Фамилия Жакипбаев — тюркская по происхождению, и её разумнее начинать не с корня, а с модели образования. Она сложена по стандартной для казахских и некоторых других тюркских фамилий схеме: личное имя + компонент «бай» + русский патронимический суффикс «-ев». В основе лежит имя Жакип — это казахская и киргизская форма арабского имени Якуб (библейский Иаков). Имя Якуб/Жакип означает «следующий», «идущий по следу», а в исламской традиции ассоциируется с пророком, отцом Юсуфа (Иосифа). Вторая часть — «бай» — в тюркских языках означает «богатый», «господин», «хозяин», часто входила в состав имён как пожелание достатка и высокого положения. Таким образом, Жакипбай — это двусоставное имя, где к имени пророка добавили титул: «богатый Жакип» или «господин Жакип». Суффикс «-ев» — чисто русский, он появился в XIX–XX веках при русификации документов, когда фамилии оформили по модели «чей?» — то есть «сын Жакипбая».

Вероятность, что предок носителя фамилии был человеком знатного или просто зажиточного сословия, существует, но не обязательна. Имя Жакипбай мог дать любой отец, желавший сыну удачи, а не только реальный бай. Географически фамилия почти наверняка казахстанская, реже — киргизская или узбекская. В русских ономастических справочниках она не упоминается, так как сложилась за пределами собственно русской фамильной системы.

Отдельного внимания заслуживает то, что фамилия не усечена — в ней сохранён полный компонент «бай», а не сокращённый до «бек» или «бий», как иногда бывает. Это указывает на относительно позднее оформление и на то, что имя-основа бытовало в среде, где «бай» ещё не стёрся в бытовой речи. В отличие от фамилий вроде Жакипов (только от имени Жакип) или Байжакипов (где порядок частей иной), Жакипбаев чётко фиксирует двусоставность антропонима. Если искать однокоренные параллели, то в той же модели существуют фамилии Жакипбаев, Жакипбай, Жакипбаевна — все они восходят к одному источнику, но различаются по степени русификации.