Конечное «-ян» (или «-янц») — это патронимический суффикс, который в армянском языке означает «из рода», «принадлежащий». То есть носитель фамилии Жамкоцян — потомок человека по прозвищу или имени Жамкоц. В отличие от русских фамилий на «-ов», которые передавались от отца к сыну, армянские фамилии на «-ян» закрепились относительно поздно, в основном в XIX веке, и указывали на родовую принадлежность.

Основа фамилии — «Жамкоц» — скорее всего, восходит к армянскому слову «жам» (ժամ), которое имеет два основных значения: «время» и «час» (а также «церковная служба»). Вторая часть — «-коц» — могла быть уменьшительным или прозвищным суффиксом. Таким образом, «Жамкоц» — это человек, имеющий отношение ко времени или к церковному часу. Правдоподобная версия: предок был звонарём, который отбивал часы на колокольне, или церковным служителем, следящим за расписанием служб. В армянской церкви «жамарарар» — это тот, кто читает часослов. Отсюда прозвище могло возникнуть как профессиональное.

Географически фамилия Жамкоцян наиболее типична для исторической Западной Армении (ныне восток Турции) и для областей вокруг озера Ван. Многие носители фамилии после Геноцида армян 1915 года оказались в диаспоре — в Ливане, Сирии, Франции, США, а затем и в России. В современной Армении фамилия встречается, но не входит в число самых массовых.

Важно отличать фамилию Жамкоцян от фамилии Жамкочян — это разные корни. В фамилии Жамкочян основа «Жамкоч» может быть связана с армянским «коч» (крик, зов), и тогда прозвище означало бы «зазывала» или «глашатай». Для Жамкоцян версия с «временем» и «церковным часом» остаётся основной и наиболее логичной, учитывая распространённость таких профессиональных прозвищ в среде сельского духовенства и прицерковных служителей.

В написании фамилии через «ц» (а не «ч») сохранилась старая орфографическая норма, которая передаёт твёрдый звук. Это тоже деталь, отличающая её от более русифицированных вариантов.