Фамилия Жамойтина звучит непривычно для русского уха, и в этом её главная подсказка. Она явно не из центральной России. Основа «жамойт» — это этноним, историческое название балтского племени жемайтов (или жамойтов), населявшего западную часть современной Литвы — Жемайтию (Жамойть). В старых русских документах и летописях жителей этого региона так и называли — «жмудь» или «жамойть». Таким образом, Жамойтина — это фамилия, образованная от прозвища Жамойт, которое давали выходцу из Жемайтии или человеку, чем-то напоминавшему литвина-жемайта.

Фамилия стоит в женской форме (Жамойтина), но её основа — мужская фамилия Жамойтин. Модель образования проста и типична для восточнославянских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — сын или потомок Жамойта). Такая форма фамилий на -ин характерна для севера России, а также для белорусских и украинских земель, где часто оседали выходцы из Великого княжества Литовского.

Интересно, что в отличие от фамилий на -ов (чаще встречающихся у русских), фамилия Жамойтин сохранила прямую этническую отсылку без лишних переосмыслений. Сословная принадлежность первых носителей могла быть разной: от крестьян, переселившихся с запада, до служилых людей «литовского списка», которые поступали на московскую службу в XV–XVII веках. В любом случае, предок носителя фамилии чётко ассоциировался с Жемайтией — землёй, которая долгое время была пограничьем между Литвой и Тевтонским орденом.