Фамилия Жамойтук — редкая и необычная по звучанию для русского уха. Её происхождение напрямую связано с историей Великого княжества Литовского и балтийским субстратом на западе современной Беларуси. Основа фамилии — топоним или этноним «Жамойть» (Жемайтия), историческая область на западе Литвы. В старых русских и польских документах жителей этого региона называли «жмудь» или «жамойть». Суффикс -ук характерен для западно-белорусской и украинской антропонимии: он указывает на принадлежность или происхождение («сын жамойта» или «выходец из Жамойти»). Таким образом, Жамойтук — это «потомок человека из Жемайтии» или «тот, кто родом с тех земель».

Словообразовательная модель здесь прозрачна: корень «Жамойт-» (этноним) + суффикс -ук (патронимический, как в фамилиях Бондарчук, Ковальчук). В отличие от типичных русских фамилий на -ов/-ев, эта модель — отражение литовско-белорусского пограничья, где веками смешивались языки и культуры. Фамилия могла закрепиться за переселенцем, который перебрался восточнее, в белорусские или польские земли, и получил прозвище по месту прежнего жительства. Географически фамилия Жамойтук встречается в основном на территории Гродненской и Брестской областей Беларуси, а также среди потомков выходцев оттуда в Польше и Литве.

Других убедительных версий происхождения нет. Соблазнительно связать фамилию с литовским словом «žemas» (низкий) или «žemė» (земля), но это дало бы иные фонетические формы. Версия с этнонимом — самая прямая и подтверждается как структурой фамилии, так и историей региона. Социально носитель фамилии скорее всего был крестьянином или мелким шляхтичем, переселившимся из жемайтских земель. В дворянских родословных книгах Российской империи эта фамилия не фиксируется, что тоже говорит о её простонародном, локальном происхождении.