Фамилия Жаныбаев ведёт начало от мусульманского мужского имени Жаныбай. Как и большинство имен восточного происхождения, имя Жаныбай имеет сложную основу. Первая часть этого имени восходит к древнетюркскому слову «джан», которое в переводе на русский язык означает «душа, дух»; «близкий, дорогой, как душа». Таким образом, один из вариантов перевода этого имени звучит как «дорогой хозяин».