Фамилия Жаныбаев происходит от мужского имени Жаныбай. Это имя, как и многие восточные антропонимы, составное. Первая его часть восходит к древнетюркскому слову «джан» — «душа, дух», а также «близкий, дорогой, как душа». Вторая часть — «бай» — в тюркских языках означает «хозяин», «господин», «богатый человек». Таким образом, имя Жаныбай можно перевести как «дорогой хозяин» или «богатый душой».

Фамилия образована по самой распространённой модели — с помощью русского патронимического суффикса -ев, который присоединяется к основе, оканчивающейся на согласный. Буквально Жаныбаев — «потомок Жаныбая». Такая модель (тюркское имя + русский суффикс) типична для фамилий народов Поволжья, Кавказа и Средней Азии, которые вошли в состав Российской империи.

Интересная деталь: в написании фамилии отразилась фонетическая адаптация. Исходный звук «дж» (как в английском «James») в русском языке передаётся через букву «ж». Это характерно для многих заимствований из тюркских языков — ср. Жандарм (через французский), Джинсы, но Жаныбай.

Социальный контекст: носителями имени Жаныбай и, соответственно, фамилии Жаныбаев, скорее всего, были люди, не принадлежавшие к высшей знати. Имя «бай» в народной среде было скорее пожелательным — им называли ребёнка, надеясь, что он вырастет состоятельным и уважаемым. Среди носителей фамилии нет широко известных исторических или публичных фигур, что говорит о её бытовании в основном в сельской местности или среди рядовых слоёв населения.