Фамилия Жанымбетова образована от мужского имени Жанымбет, которое представляет собой типичное для тюркских народов составное имя. Первая часть — «жаным» (в переводе с казахского и ряда других тюркских языков — «душа моя», «любимый»), вторая — «бет» (варианты: «бек», «бий» — «господин», «князь», «владыка»). Таким образом, имя Жанымбет можно истолковать как «любимый господин» или «душа-князь» — пожелание, чтобы ребёнок был дорог и уважаем, занимал высокое положение. Имена с компонентом «жан» (душа) широко распространены у казахов, киргизов, ногайцев и других народов; они подчёркивают эмоциональную ценность ребёнка для родителей.

Суффикс -ов указывает на русскую модель оформления фамилии, характерную для народов, вошедших в состав Российской империи. В XIX–XX веках при записи тюркских имён в официальных документах к ним часто добавляли русские патронимические окончания. В данном случае фамилия Жанымбетова — это форма женского рода; мужской вариант — Жанымбетов. Такие фамилии не имели сословной окраски: их могли получить и крестьяне, и кочевники, и представители знати, если имя попадало в метрические записи.

Географически фамилия Жанымбетова встречается прежде всего в Казахстане, особенно в южных и западных областях, а также среди казахской диаспоры в России (Астраханская, Оренбургская области). Встречаемость невысокая — это не массовая фамилия, что говорит о её локальном происхождении, вероятно, от конкретного родоначальника, носившего имя Жанымбет. В отличие от фамилий на -баев или -улы, модель с -ов закрепилась в основном у оседлого или записанного в ревизские сказки населения.

Однокоренные фамилии — Жаныбеков, Жанымбеков, Бетжанов — встречаются реже и могут указывать на перестановку частей имени или вариативность произношения. Если в основе лежит не имя, а прозвище (например, «жаным бет» — «лицо души» в переносном смысле), то это маловероятно: прозвища такого типа нехарактерны для тюркской антропонимии. Основная версия — происхождение от личного имени с пожелательной семантикой — остаётся наиболее обоснованной.