Фамилия Желубёнков образована от прозвища Желубёнок. Оно ведет свое начало от нарицательного «желоб» - «длинное и узкое углубление, канал для стока воды, обычно выдолбленный в полукруглом бревне или сделанный из свернутого листового железа». Можно предположить, что основатель рода Желубёнковых занимался выкапыванием сточных каналов. Возможно также, что Желубёнком окрестили высокого, худого человека. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Желубёнок, со временем получил фамилию Желубёнков.