Фамилия Желубёнов образована от прозвища Желубёный. Оно ведет свое начало от нарицательного «желоб» - «длинное и узкое углубление, канал для стока воды, обычно выдолбленный в полукруглом бревне или сделанный из свернутого листового железа». Можно предположить, что основатель рода Желубёновых занимался выкапыванием сточных каналов. Возможно также, что Желубёным окрестили высокого, худого человека. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Желубёный, со временем получил фамилию Желубёнов.