Фамилия Жигандарова — одна из тех, чья форма сразу бросается в глаза. Она образована по продуктивной русской модели с суффиксом -ов, который превращает в фамилию имя или прозвище отца. В женском роде к основе добавляется окончание -а. Мужской вариант — Жигандаров. Но необычность здесь не в суффиксе, а в корне.

Основа «Жигандар» явно не славянского происхождения. Скорее всего, перед нами сложное имя или прозвище тюркского или иранского корня. Первая часть «жиган» (jahan) в персидском и ряде тюркских языков означает «мир», «вселенная». Вторая часть — «дар» — также иранская, означает «имеющий», «владеющий» (как в именах Бахтияр, Джахангир). Таким образом, имя Джахандар (Жигандар) можно перевести как «владеющий миром» или «миродержец». Это типичный для восточных культур комплиментарный антропоним, который давали с пожеланием силы и могущества.

Фамилия могла возникнуть в среде татар, башкир или других тюркских народов Поволжья и Приуралья, где такие имена были распространены. В русскую фамильную систему она попала через процесс христианизации или просто через фиксацию в документах: крестьянина или мещанина по имени Жигандар записали как Жигандаров. Учитывая редкость фамилии, её носители, скорее всего, имеют общие корни с небольшой группой предков, выходцев из одного села или рода.

Встречаются написания с буквой «а» в конце мужского варианта (Жигандара), что указывает на возможное происхождение из языков, где ударение падает на последний слог. Но в русском языке закрепилась форма на -ов. Фамилия не имеет отношения к русскому слову «жиган» (вор, озорник), несмотря на внешнее сходство. Связь с «жиганом» — народная этимология, которая ошибочна.