Фамилия Жилонов — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Её основа, «Жилон», не встречается в современных русских именах или распространённых прозвищах, поэтому разбирать её приходится по косвенным данным: словообразовательной модели, возможным диалектным корням и параллелям в других фамилиях.

Суффикс -ов указывает на классическую русскую патронимическую модель: Жилонов — это «сын Жилона». Само имя или прозвище Жилон могло возникнуть несколькими путями. Первая версия — от глагола «жилить» (в северных и сибирских говорах означало «скупиться, жадничать, тянуть себе»). Жилоном могли назвать прижимистого, расчётливого человека, который «жилится» — с трудом расстаётся с добром. Вторая версия — отчество от неканонического имени Жила, которое встречается в древнерусских актах (например, крестьянин Жила, XV век). Форма Жилон могла быть уменьшительной или производной, с суффиксом -он, как в именах Мирон (от Мир) или Созон (от Созонт). Третья, менее вероятная, — связь с тюркскими корнями, где «жил» (jıl) означает «год», но для фамилии с русским суффиксом -ов это скорее случайное созвучие.

Географически фамилия Жилонов встречается крайне редко, в основном в центральных и южных областях России — Воронежской, Ростовской, Волгоградской. Это указывает на локальное бытование прозвища, не получившего широкого распространения. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках фамилия почти не фиксируется, что говорит о её позднем оформлении (вероятно, в XIX веке) или о малочисленности рода.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Жилин, Жильцов, Жиляев — показывает, что основа «жил-» в русской ономастике продуктивна, но Жилонов стоит особняком. В отличие от Жилина (от «жила» — кровеносный сосуд или скупой человек) или Жильцова (от «жилец»), Жилонов образован через редкий суффикс -он, который придаёт фамилии оттенок уменьшительности или принадлежности к конкретному лицу. Это может указывать на то, что предок носителя был известен в своей общине именно как «Жилон» — возможно, младший сын в семье или человек с характерной чертой, закрепившейся в прозвище.

Социальный контекст: скорее всего, Жилоновы — потомки крестьян или однодворцев. Фамилии на -ов без дворянских приставок типичны для непривилегированных сословий, а редкое прозвище говорит о том, что род не был многочисленным и не дал известных исторических фигур.