Фамилия Жиндаева — это, скорее всего, женская форма фамилии Жиндаев, и чтобы понять её происхождение, нужно разобрать мужской вариант. Словообразовательная модель здесь простая: основа «Жинда(й)» плюс типичный русский суффикс принадлежности -ев. Этот суффикс указывает на то, что фамилия образована от прозвища или имени, оканчивающегося на мягкий согласный или на -й.

Корень «Жинд-» не является ни общеславянским, ни частотным в русском языке. Скорее всего, он иноязычного происхождения. Самая вероятная версия связывает фамилию с тюркскими языками, где слово «жин» или «джын» означает «дух», «демон», «нечистая сила» (сравните с казахским «жын», татарским «җен»). В таком случае прозвище Жиндай могли дать человеку, которого считали беспокойным, странным, одержимым или, наоборот, обладающим мистическими способностями — знахарю, шаману. Суффикс -ай в тюркских именах и прозвищах часто придаёт уменьшительно-ласкательный или характеризующий оттенок, так что «Жиндай» могло означать «маленький дух» или «похожий на духа».

Вторая, менее распространённая версия — связь с кавказскими языками. В некоторых диалектах встречается основа «жинд» со значением «сильный», «крепкий», «здоровый». Тогда прозвище могло характеризовать физическую силу человека.

Географически фамилия Жиндаева наиболее характерна для регионов Северного Кавказа и Поволжья, где сильны тюркские языковые влияния. Встречается она среди осетин, чеченцев, ингушей и татар. В русских исторических документах эта фамилия не фиксировалась, что подтверждает её относительно позднее происхождение (XVIII–XIX века) и связь с нерусскими этносами, которые при переходе в православие или при записи в метрические книги получали фамилии по отцовскому прозвищу.

Таким образом, предок носительницы фамилии Жиндаева мог быть человеком с необычным, возможно, пугающим нравом (от «духа»), либо физически крепким мужчиной (от «сильного»). Точное значение зависит от региона, но тюркский след кажется более обоснованным из-за широкого распространения корня «жин» в значении «дух» в целом ряде языков.