Фамилия Жолондковская — женская форма польской фамилии Жолондковский (Żołędkowski). Её основа прозрачна для того, кто знаком с польской лексикой: «żołądź» — это «жёлудь». Суффикс -овск-/-евск- типичен для шляхетских фамилий, образованных от названий поместий или местности. То есть первый носитель такой фамилии, скорее всего, получил её по названию имения или хутора — Жолондек (Żołędek) или Жолондково (Żołędkowo). Таких топонимов в Польше несколько, и все они восходят к дубовым рощам или характерному ландшафту, где водилось много желудей.

Слово «żołądź» в польском языке имеет и второе, анатомическое значение (головка полового члена), но в фамилиях этот смысл никогда не закладывался — ономастика однозначно связывает её с ботаническим образом. В русском языке фамилия закрепилась в форме Жолондковская с буквой «о» в первом слоге, хотя по-польски правильно Żołędkowska — через «ę» (носовой звук). Такая адаптация типична для фамилий, попавших в русскую среду в XIX — начале XX века: носовые гласные заменялись привычными «он» или «ен».

В отличие от большинства русских фамилий на -ская, которые в XIX веке часто искусственно создавались в духовных училищах из названий церквей или сёл, Жолондковская имеет шляхетское, а не семинарское происхождение. Носители этой фамилии — как правило, потомки мелкой польской шляхты, которая после разделов Речи Посполитой оказалась на территории Российской империи, в основном в западных губерниях (Виленской, Гродненской, Минской). Встречается она и среди белорусов-католиков, и среди полонизированной украинской шляхты.

Редкость фамилии объясняется тем, что она не разошлась широко за пределы нескольких гнёзд. В современных польских телефонных справочниках Żołędkowski — фамилия немногочисленная, а в России и Беларуси Жолондковские — это, как правило, потомки тех самых шляхетских родов, уехавших или переселенных вглубь империи после восстаний 1830 и 1863 годов.