Фамилия Жуперкова — женская форма фамилии Жуперков, и её разбор стоит начать с корня, который неочевиден и вызывает споры. В русских фамилиях на -ов/-ев основа чаще всего восходит к прозвищу или имени, и здесь мы имеем дело с редким случаем, когда корень «жуперк-» не имеет прямых аналогов в современном языке. Вероятнее всего, он связан с диалектным словом «жупер» или «жупера», которое в некоторых говорах означало «жук» или «насекомое», иногда в переносном смысле — «мелкий, суетливый человек». Такая основа могла дать прозвище Жуперок (с уменьшительным суффиксом -ок), от которого и пошла фамилия: Жуперок → Жуперков — «сын или потомок Жуперка».

Менее вероятная, но возможная версия — связь с украинским или белорусским «жупер» как вариантом слова «жупан» (верхняя одежда). В этом случае прозвище могло относиться к человеку, носившему такую одежду или шившему её, но фонетически переход «жупан» в «жупер» встречается редко и требует дополнительных доказательств. Третья гипотеза — иноязычное происхождение, например, от тюркского «жуп» (пара) с суффиксом -ер, но для фамилии Жуперкова такая этимология выглядит натянутой, так как в русской ономастике нет устойчивых параллелей.

Суффикс -ов указывает на принадлежность: в XVI–XVII веках так образовывали фамилии от прозвищ и имён, чаще всего в крестьянской и мещанской среде. Жуперковы, судя по всему, были выходцами из северных или центральных губерний России, где диалектная лексика сохраняла подобные корни. Встречаемость фамилии низкая — она не входит в списки распространённых, что говорит о локальном происхождении, возможно, из одной деревни или волости.

В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» нет прямого упоминания Жуперкова, но модель на -ов с неясным корнем типична для «тёмных» фамилий, которые часто расшифровываются через местные говоры. Если ваш предок носил прозвище Жуперок, он мог быть либо невысоким и подвижным человеком (от «жук»), либо иметь отношение к насекомым в хозяйстве — например, пчеловодству, где жуки считались вредителями. Точных данных о сословии нет, но суффикс -ов редко встречается у дворян, так что скорее всего это фамилия крестьян или посадских людей.