Фамилия Жужгина — женская форма, мужская — Жужгин. Её ядро — прозвище Жужа, Жужга, а за ним, скорее всего, стоит не звукоподражание насекомому, а живой диалектный глагол. В северных и сибирских говорах «жужать» значило «жужжать», но также «быстро и беспокойно двигаться», «суетиться». Жужгой в народе называли непоседу, егозу, человека, который не сидит на месте. Такое прозвище давали либо очень подвижному ребёнку, либо хлопотливому, вечно занятому взрослому.

Модель образования простая: основа «жужг-» плюс патронимический суффикс -ин, указывающий на принадлежность: «сын Жужги». Фамилия исконно русская, сформировалась в крестьянской среде, где прозвища были точнее имён. Суффикс -ин, а не -ов, намекает на то, что исходное прозвище оканчивалось на -а или -я: Жужа, Жужга. Форма Жужгин — типичная для северных и центральных областей России, где такие прозвища давали по личным качествам, а не по профессии.

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с диалектным «жужга» — так в некоторых местах называли золу, гарь, или что-то обожжённое. Но здесь логика слабее: прозвище «Зола» или «Гарь» для человека — редкость, а вот прозвище по характеру — массовое явление. Поэтому версия с «непоседой» и «суетой» — основная.

Фамилия встречается в основном на севере европейской части России и в Поволжье. Например, в Вологодской, Кировской, Костромской областях. Встречается и у старообрядцев, которые часто сохраняли архаичные прозвища в быту. В современных справочниках фамилия редкая, не входит даже в первую тысячу по частотности. Её носители — потомки тех самых «жужистых» людей, которых в деревне отличала живость и непоседливость.