Фамилия Зиков образована от имени или прозвища Зик. Самая очевидная версия — сокращённая форма церковного имени Зиновий (греч. «живущий по-божески»). В крестьянской среде полное имя редко употребляли в быту, вместо него использовали укороченные варианты: Зина, Зиня, Зика. Суффикс -ка в таких случаях указывал на ласкательное или обиходное обращение (сравните: Ваня — Ванька, Петя — Петька). От прозвища Зика через притяжательное прилагательное («чей?» — Зиков) и возникла фамилия.

Менее распространённая версия связывает основу с диалектным словом «зик» — в некоторых северных говорах так называли крикливого, задиристого человека, буквально «визгун» (от звукоподражания «зик!»). В этом случае фамилия могла закрепиться за обладателем беспокойного характера или громкого голоса.

Фамилия Зиков — типично русская, с патронимическим суффиксом -ов. Она встречается преимущественно в центральных и северных областях России, особенно в Вологодской и Архангельской губерниях, что косвенно подтверждает северное происхождение прозвищной версии. В старых переписных книгах XVII века упоминаются крестьяне Зиковы в Тотемском уезде — это один из ранних документальных следов фамилии.

Интересно, что фамилия Зиков не имеет ничего общего с фамилией Зыков, хотя их часто путают на слух. Зыков происходит от «зыкать» — издавать громкий звук, а Зиков — от «зикать» (визжать) или от имени Зиновий. Разница в корневой гласной (и/ы) указывает на разные словообразовательные гнёзда.

Сегодня фамилия Зиков остаётся сравнительно редкой. Её носители могут с равной вероятностью вести род от крестьянина Зиновия, которого в деревне звали Зикой, или от прозвищного Зика — крикливого мужика, чья брань разносилась по всей округе.