Фамилия Злобенко — яркий пример восточнославянской модели фамилий на -енко, характерной прежде всего для Украины. Суффикс -енко в XVI–XVII веках был основным способом образовать фамилию по отцу или по прозвищу, и означал «маленький», «сын» или «потомок». Поэтому Злобенко — это буквально «сын Злобы» или «потомок человека по прозвищу Злоба».

Основа фамилии — древнерусское нецерковное имя или прозвище Злоба. В старину такие имена не несли прямого негативного смысла, а были обережными: называя ребёнка Злобой, родители надеялись, что он вырастет добрым и покладистым, или же подчёркивали его внешнюю суровость. Прозвище могло закрепиться и за взрослым человеком с тяжёлым характером, угрюмым или вспыльчивым. Следы этого имени встречаются в документах XV–XVII веков: например, в новгородских и псковских грамотах упоминаются крестьяне и посадские люди по прозвищу Злоба.

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще закреплялись в центральной и северной Руси, фамилии на -енко типичны для земель современной Украины и юга России. Носители фамилии Злобенко, скорее всего, происходят из казацкой или крестьянской среды Левобережной Украины (Полтавщина, Черниговщина, Слобожанщина), где модель на -енко была особенно популярна. Позже, с миграциями, фамилия распространилась и в другие регионы.

Интересно, что в русском языке слово «злоба» имеет резко негативную окраску, но в качестве фамильной основы оно не уникально: существуют однокоренные Злобин, Злобов, Злобичев. Злобенко стоит в этом ряду особняком именно из-за суффикса, который сразу указывает на южнорусское или украинское происхождение. Если встречаются варианты написания с одной «б» или через «а» (Злабенко), это, скорее всего, результат диалектного произношения или ошибок в документах.

Таким образом, предок современных Злобенко — человек, которого в своём окружении называли Злобой. Он мог быть суровым, неуступчивым, а мог просто носить обережное имя, данное в надежде на счастливую судьбу. Фамилия не указывает на дворянское происхождение — её носители, как правило, были казаками, крестьянами или мещанами.