Фамилия Знахарюк — яркий пример того, как профессиональное прозвище, а не крестильное имя, легло в основу родового имени. В отличие от большинства русских фамилий на -ов/-ев, образованных от мирских или канонических имён, Знахарюк отсылает напрямую к занятию предка. Он был знахарем — человеком, который лечил травами, заговорами, народными средствами. В дореволюционной деревне знахарь не был колдуном в современном мистическом смысле; это практикующая должность, часто единственная доступная медицинская помощь крестьянам. Такое прозвище давалось не случайно — оно указывало на реальное ремесло, передававшееся в семье.

Фамилия восточнославянская, но её суффикс -юк выдаёт конкретный регион происхождения. Это типично для украинских и белорусских фамилий, особенно для Подолья, Волыни, Полесья. Если бы фамилия образовалась в центральной России, она, скорее всего, выглядела бы как Знахарёв. Суффикс -юк в данном случае означает «потомок знахаря» или «принадлежащий знахарю», то есть изначально это было отчество — «сын Знахаря». В польских землях встречалась бы форма Знахарчик, а в южнославянских — Знахар.

Интересно, что слово «знахарь» — исконно славянское, образовано от глагола «знать» (сравните: «знающий»). В народной культуре знахарь противопоставлялся колдуну: колдун получал силу от нечистой силы, а знахарь — от знания природы, трав, молитв. Поэтому фамилия Знахарюк, в отличие от, скажем, Колдунов, не несёт негативного оттенка. Это фамилия уважаемого в общине человека, к которому ходили за помощью.

С точки зрения словообразования, фамилия прозрачна: корень знах-, суффикс -арь- (обозначающий деятеля), и патронимический суффикс -юк. Ударение, скорее всего, на последнем слоге — Знахарю́к, хотя в некоторых говорах возможно смещение на второй слог. Встречаются варианты написания через «а» (Знахорюк) — это влияние акающих говоров, но основная форма устойчива.

Поскольку фамилия профессиональная, она не указывает на сословное происхождение: знахарем мог быть и крестьянин, и мещанин, и даже казак. В ревизских сказках XIX века носители фамилии Знахарюк встречаются преимущественно в Волынской и Киевской губерниях. Сейчас фамилия распространена в Украине, на юго-западе Беларуси и среди потомков переселенцев в Сибири и на Дальнем Востоке.