Фамилия Знакос — редкая, почти штучная. Её не встретишь в списках массовых крестьянских фамилий центральной России, и её происхождение лежит не в прозвище по занятию или внешности, а в книжной, грамотной среде. Основа здесь — греческое слово «знак» (σημεῖον, sēmeion), которое в церковнославянском и русском языке XVIII–XIX веков означало не только «метка» или «символ», но и «чудо», «знамение», «предзнаменование». Фамилия могла возникнуть в среде духовенства, где было принято давать семинаристам «искусственные» фамилии на греческий лад — по богословским понятиям, названиям праздников или церковных символов. В этом ряду стоят Знаменский, Крестовоздвиженский, Знамениев — и Знакос, скорее всего, сокращённая или переосмысленная форма от «Знакоский» или «Знакосов», но с явным греческим окончанием.

Суффикс -ос здесь необычен для русской фамилии. Он не свойственен ни крестьянским, ни дворянским фамилиям, которые обычно оканчиваются на -ов, -ев, -ин, -ский. Окончание -ос прямо указывает на греческое влияние: так образовывали фамилии в среде малороссийского или южнорусского духовенства, где греческая учёность была в чести. Встречается фамилия Знакос в основном на юге России и в бывших землях Войска Запорожского, что подтверждает гипотезу о семинарском или церковном корне. Второй, менее вероятный вариант — что фамилия произошла от прозвища «Знакос» (человек, который ставит знаки, метит имущество или знает знаки, приметы), но такая модель нехарактерна для русской ономастики: прозвища на -ос почти не давали фамилий.

Словообразовательно фамилия проста: корень «знак-» + формант -ос, который, по сути, является частью основы, а не типичным русским суффиксам. Это сближает её с фамилиями типа Афанасьев, но без отчества — скорее, это прямое заимствование греческого слова в качестве фамильного имени. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) такие случаи описаны как «семинарские фамилии», образованные от богословских терминов. Если ваши предки носили фамилию Знакос, они, скорее всего, были из духовного сословия — священниками, диаконами или псаломщиками, получившими фамилию при поступлении в семинарию. В быту её могли переиначить на Знаков или Знаковский, но исходная форма сохранилась как редкий, но точный след книжной культуры.