Фамилия Знакина — женская форма фамилии Знакин. Чтобы понять её происхождение, нужно разобрать мужской вариант, который образован по типичной русской модели с суффиксом -ин. Он указывает на принадлежность: Знакин — это «чей?» — сын или потомок человека по прозвищу Знак или по имени Знак.

Ключ к разгадке — слово «знак». В старину у него было больше значений, чем сейчас. Прозвище Знак могли дать человеку с яркой, запоминающейся внешностью: родинкой, шрамом, родимым пятном — то есть с некой отличительной «меткой». В некоторых говорах «знаком» называли знахаря или колдуна, который «знает» (ведает) тайные силы. Есть и более бытовая версия: Знаком могли прозвать того, кто ставил метки на имущество, работал с документами или печатями — например, сельского писаря или сборщика податей.

В русской ономастике фамилия Знакин встречается нечасто. Географически она тяготеет к центральным и северным регионам России, где прозвища, образованные от нарицательных существительных без уменьшительных суффиксов, были особенно распространены. Сравните с однокоренными фамилиями Знаков, Знаковский — они редки и, скорее всего, имеют книжное или семинарское происхождение, тогда как Знакин — народная, «уличная» фамилия.

Таким образом, предок носительницы фамилии Знакина был человеком с приметной внешностью, либо знахарем, либо чиновником-меточником. Точное значение сегодня установить невозможно, но все три версии ведут к одному корню — слову «знак». Фамилия записана как Знакина, а не Знакина с ударением на второй слог (что иногда путают с вариантом от имени Зинаида), что подтверждает её прозвищное, а не крестильное происхождение.