Фамилия Знамина — одна из тех, что образованы не от имени или профессии, а от предмета или понятия. В её основе лежит слово «знамя» (старое написание — «знамѧ»), то есть воинское знамя, стяг. Модель образования типична для русских фамилий: основа плюс суффикс принадлежности -ин. Знамин — «чей?» — сын или слуга человека, которого называли Знамя. А вот почему человека так прозвали — тут возможны варианты.

Самая прямая версия: прозвище Знамя могли дать знаменосцу. В войске знаменосец был заметной фигурой — под знаменем строился полк, потеря стяга считалась позором. Со временем прозвище приросло к человеку, а затем и к его потомкам. Менее очевидная, но тоже возможная версия — связь с церковнославянским словом «знамение» (чудо, предзнаменование). В этом случае прозвище Знамя мог получить человек, с которым связывали какое-то приметное событие, или же тот, кто жил у храма, посвящённого иконе «Знамение» (Богоматерь Знамение).

Суффикс -ин указывает на то, что фамилия формировалась в северных и центральных русских землях, где этот патронимический суффикс был особенно распространён (в отличие от южнорусского -ов/-ев). Встречается фамилия и в форме Знамёнкин, образованной от той же основы, но с уменьшительным суффиксом. В дореволюционных метрических книгах Знамины могли записываться и через «ять» — Знамѧнин, что подтверждает древнее происхождение корня.

Сословная принадлежность у Знаминых не застыла: в XIX веке носители фамилии встречались и среди крестьян (например, в Вятской и Костромской губерниях), и среди мещан, и даже среди духовенства — в среде священников фамилии нередко давали по храмовым праздникам или иконам. Поэтому однозначно сказать, кем были предки, нельзя — только по конкретной семейной истории. Но ясно одно: прозвище дали человеку заметному, связанному либо с военным делом, либо с церковным символом.