Фамилия Зохраев — одна из тех, что сразу выдают тюркские или иранские корни. Основа её — мужское личное имя Зохра, которое в свою очередь восходит к арабскому «Зухра» (زهرة) — «цветок», «краса», «сияние». В исламской традиции это имя связано с Венерой (звезда Зухра), а также с дочерью пророка Мухаммада Фатимой, которую называли «аз-Захра» — «сияющая», «светлая». Так что исходное значение фамилии — «потомок Зохры», «принадлежащий Зохре».

Суффикс -ев указывает на русскую модель образования фамилий от иноязычных основ. В тюркских языках (татарском, башкирском, азербайджанском, кумыкском) и в среде кавказских народов имя Зохра (или Зухра) было распространено, и при переходе в русскую документацию к нему добавили стандартный патронимический суффикс. Фамилия могла возникнуть в среде татарского или башкирского дворянства, а также у горских евреев — в их среде имя Зохра тоже встречается, и фамилии на -ев там обычны.

Географически фамилия Зохраев встречается в Дагестане, Чечне, Татарстане, а также среди азербайджанцев. Встречаются варианты написания: Зухраев (с буквой «у» в первом слоге) — это след арабского произношения (зухра), тогда как «Зохраев» — результат обрусения или местного диалектного произношения. Иногда путают с фамилией Захраев, но там корень другой — от имени Захар.

Редкость фамилии в том, что она не массовая: в России по данным переписей её носителей несколько сотен, не больше. Это не фамилия крестьянского большинства, а скорее след культурного слоя — грамотных людей, получивших фамилию при советской паспортизации в 1920–1930-х годах. Предки носителей фамилии могли быть муллами, торговцами или ремесленниками, сохранившими память о родоначальнике, которого звали Зохра.