Фамилия Зыкалин — один из тех редких случаев, когда в основе лежит не имя и не профессия в привычном смысле, а скорее звуковой портрет человека. Она образована от прозвища Зыкало, а то, в свою очередь, — от глагола «зыкать». Этот глагол в старых говорах имел целый веер значений: «громко кричать, звать», «рыдать навзрыд», «протяжно петь» или просто «издавать долгий, тягучий звук». Исходя из этого, прозвище Зыкало могли дать либо крикливому и шумному человеку, либо, напротив, тому, кто обладал сильным и звонким голосом — например, певцу или глашатаю.

Суффикс «-ин» в фамилии Зыкалин указывает на принадлежность: «чей?» — Зыкалин, то есть сын, потомок или человек из семьи Зыкалы. Такая модель типична для центральных и северных русских земель. В южных и западных регионах скорее появилась бы фамилия Зыкаленко или Зыкальский, но здесь мы видим именно «-ин», что сужает географию происхождения фамилии до великорусских областей.

В «Ономастиконе» Степана Веселовского сохранились записи об однокоренных именованиях, датированных XV–XVI веками. Упоминаются слуга митрополита Зык Обобуров, помещик Зык Моисеев (1539 год), крестьянин Артемий Зыкун (конец XV века) и новгородец Зычко (1551 год). Эти примеры показывают, что корень «зык-» был довольно распространён в допетровской Руси и использовался как для личных имён, так и для прозвищ. Важно, что среди них нет прямого упоминания «Зыкало» — это означает, что фамилия Зыкалин могла возникнуть локально, в конкретной местности, и не получила широкого распространения в документах того времени.

Есть и другая версия: прозвище Зыкало могло быть не бытовым, а языческим именем-оберегом. В древности родители могли назвать капризного, плачущего ребёнка Зыкалой — в надежде, что имя «перерастёт» и ребёнок станет спокойным. Такая практика была обычной для славянского именослова, где имя часто описывало нежелательное качество, чтобы его отпугнуть.

Фамилия Зыкалин не относится к числу распространённых. Она встречается эпизодически, что говорит о её локальном происхождении — скорее всего, от одного родоначальника в конкретном селе или волости. Точное место и время появления фамилии можно установить только через глубинные генеалогические изыскания, но уже сейчас ясно, что носитель этой фамилии — потомок человека, которого в округе запомнили по его голосу: зычному, громкому или плаксивому.