Основой фамилии Зюлин послужило мирское имя Зюля. По одной из версий, фамилия Зюлин образована от имени, которое восходит к литовскому слову zylė - «синица». Имена, образованные от названий птиц и животных, были популярны у многих народов. Согласно другой гипотезе, фамилия Зюлин происходит от прозвища Зюля, в основе которого лежит польское слово zulke, что в переводе на русский язык означает «желчь» - «желтая или зеленоватая жидкость горького вкуса, вырабатывается печенью». Возможно, Зюлей называли больного человека. Однако, не исключено, что в основу прозвища легло переносное значение этого нарицательного, а именно «раздражение, злоба». В таком случае можно предположить, что это прозвище указывало на черты характера его обладателя: раздражительность, агрессию. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Зюля, со временем получил фамилию Зюлин.