Фамилия Зюзюков — из тех, что образованы от прозвища. В её основе лежит слово «зюзя», которое в вологодских говорах имело значение «смирный, тихий человек». Если следовать этой версии, прозвище Зюзюк дали предку за покладистый нрав или спокойное поведение.

Но есть и другой вариант. Глагол «зюзюкать» в некоторых русских диалектах означал «картавить, шепелявить, нечисто произносить шипящие». Тогда прозвище Зюзюк могло закрепиться за человеком с характерной манерой речи — невыговариванием или смягчением звуков. Обе гипотезы имеют право на существование, и каждая по-своему объясняет, за что предок получил своё прозвище.

Сама фамилия построена по стандартной модели: к основе Зюзюк прибавили суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — Зюзюков). Это типичный для русских фамилий способ — так образовывали фамилии от прозвищ, оканчивающихся на согласный. Встречаются и однокоренные фамилии — Зюзин, Зюзюкин, но Зюзюков отличается именно суффиксом, что говорит о самостоятельном прозвище, а не об уменьшительном имени.

Никаких документальных свидетельств о сословной принадлежности первых Зюзюковых нет — фамилия могла возникнуть как в крестьянской, так и в мещанской среде. Прозвища, лёгшие в её основу, распространены в северных и центральных губерниях России, поэтому географически фамилия скорее всего связана с Вологодчиной или соседними областями.