Фамилия Зюзенко — яркий пример украинской модели фамилий на -енко, которая в XVII–XVIII веках стала одной из самых массовых на Левобережной и Слободской Украине. Суффикс -енко изначально означал «маленький» или «сын»: Зюзенко — это «сын Зюзя» или «потомок Зюзя». По этой же схеме сложились тысячи украинских фамилий — от Шевченко до Тимошенко.

Основа фамилии — прозвище Зюзя. В украинских и южнорусских говорах так называли зябкого, мерзлявого человека, который постоянно кутается, дрожит от холода. Глагол «зюзати» означал «жаться от стужи», а в переносном смысле — быть вялым, сонным. Есть и другая, менее распространённая версия: в некоторых диалектах «зюзя» — это тот, кто сосёт, капризничает (от «зюкать» — сюсюкать). Но первая, «зябкая», версия убедительнее: она встречается в ономастических работах и подтверждается географией фамилии.

Интересно, что фамилия Зюзенко, в отличие от многих «холодных» прозвищ, не ушла в тень. Она сохранилась в основном на востоке Украины и в приграничных регионах России — в Воронежской, Ростовской областях, на Кубани. Это указывает на то, что предки носителей фамилии, вероятно, были казаками или крестьянами, переселявшимися в XVI–XIX веках на южные земли. Прозвище Зюзя, скорее всего, дали не за физический недостаток, а за привычку — человек постоянно кутался, даже в теплую погоду, или был медлительным.

В русских фамилиях аналогом Зюзенко можно считать Зюзина или Зюзикова — они тоже образованы от того же корня, но через другие суффиксы. Однако форма на -енко однозначно говорит об украинском происхождении. Никаких дворянских родов с этой фамилией не известно — она бытовала в простонародной среде, и её носители не оставили заметного следа в дореволюционных родословных книгах.