Фамилия Абатыров образована от личного имени Абатыр, которое, скорее всего, является фонетическим вариантом имени Айбатыр. Разбираем имя Айбатыр по составу: первая часть восходит к древнетюркской основе «ай» со значением «красивый, ценный», а вторая — к персидскому слову «батыр» — «герой, богатырь». В сумме получаем «красивый богатырь». Потомок человека с таким именем и получил фамилию Абатыров.

Типичная модель образования через суффикс -ов указывает на русскую адаптацию тюркского имени: «чей?» — Абатыров, то есть сын или потомок Абатыра. В тюркской среде ту же функцию выполняют форманты -оглы/-оглу (например, Абатыроглы), но в русском документообороте закрепилась именно форма с суффиксом -ов.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где смешивались тюркские и славянские традиции именования: Поволжье, Урал, Северный Кавказ. У башкир, татар и казахов имя Батыр (и его варианты) было распространённым и нередко давалось как пожелание силы и доблести. Айбатыр — более редкая, «украшенная» форма, где эпитет «ай» (красивый, лунный, ценный) усиливал основное значение.

Встречаются и другие версии происхождения: некоторые исследователи связывают основу «ай» с луной, трактуя имя как «лунный богатырь», что в тюркской мифологии звучит не менее весомо. Однако более правдоподобной остаётся версия с оценочным значением «красивый/ценный», поскольку в антропонимии тюркских народов «ай» чаще выступает именно как положительная характеристика, а не прямой астрономический указатель.

Фамилия Абатыров — пример того, как тюркское составное имя, пройдя через русскую паспортную систему, сохранило свою внутреннюю форму, но сменило окончание на привычное для славянского уха. Носители фамилии, скорее всего, ведут род от человека, которого в своём сообществе выделяли как удалого и статного воина.