Фамилия Абдрафигин — довольно редкая, и её разговор стоит начать с корня, а не с суффикса. Основа здесь — арабское имя Абдрафиг (или Абдрафик), которое восходит к сложносоставному имени Абд ар-Рафик. Первая часть, «абд», означает «раб» (в религиозном контексте — раб Божий), вторая — «ар-Рафик» — один из эпитетов Аллаха, «Добрый», «Сострадательный». Имя Абдрафиг переводится как «раб Доброго» или «раб Сострадательного». Это типичная модель для мусульманских имён, где «абд» соединяется с одним из 99 имён Всевышнего.

Русский суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Абдрафигин, то есть сын или потомок человека по имени Абдрафиг. Такая модель образования фамилий через притяжательное прилагательное характерна для русской ономастики, особенно для фамилий, образованных от имён, прозвищ или профессий, оканчивающихся на согласный или -а/-я. В данном случае мы видим, как арабо-тюркское имя получило русское фамильное оформление, что типично для народов Поволжья и Приуралья, где веками жили татары, башкиры и другие мусульманские народы в составе Российского государства. Вариант написания через «и» (Абдрафигин, а не Абдрафиков) подтверждает, что основа имени воспринималась на слух как оканчивающаяся на мягкий согласный или «г», что и дало суффикс -ин.

Географически фамилия Абдрафигин чаще всего встречается в Татарстане, Башкортостане и соседних регионах. Можно предположить, что предки носителя этой фамилии были муллами, торговцами или крестьянами, принявшими фамилию в XIX — начале XX века, когда у татар и башкир начали массово закрепляться наследственные фамилии по отцу. В отличие от более частых фамилий вроде Абдуллин или Абдрахманов, Абдрафигин встречается реже, что делает её более локальной и, возможно, указывает на конкретный род или селение. Спорных версий происхождения здесь немного — прозрачная арабская этимология и чёткая русская модель словообразования не оставляют простора для альтернативных толкований.