Фамилия Абдрафиков образована от мусульманского имени Абдрафик. Это сложносоставное имя: первая часть восходит к тюркскому «Абди» (или «Абду»), что означает «вечный, бесконечный» или «слуга, раб Божий». Вторая часть — арабское имя Рафик, которое переводится как «друг», «товарищ», «спутник» или «добросердечный». В целом имя Абдрафик буквально означает «вечный друг, слуга Божий, спутник».

Фамилия образована по распространённой модели с суффиксом -ов, который в русском языке указывает на принадлежность: Абдрафиков — «сын Абдрафика». Такие фамилии типичны для тюркских народов, принявших русскую патронимическую систему в XIX–XX веках. Встречается фамилия преимущественно в Татарстане, Башкортостане и среди татарской диаспоры в других регионах России.

Интересно, что имя Рафик в арабском мире имеет устойчивый религиозный оттенок: в исламе «ар-Рафик» — одно из имён Аллаха, означающее «Добрый, Мягкий». Сочетание «раб Доброго» (Абд ар-Рафик) даёт имя, подчёркивающее смирение перед Богом. Однако в фамилии Абдрафиков вторая часть записана без артикля «ар-», что типично для тюркской адаптации: сложные имена часто упрощались при заимствовании.

Среди однокоренных фамилий — Абдрафиев, Абдрафин, а также более редкие Абдрафиковы с ударением на второй слог. Вариант с суффиксом -ов, а не -ин, указывает на то, что основа имени оканчивается на согласный (Рафик), что и определило форму фамилии. Встречается также написание через «х» — Абдрафихов, но это скорее диалектное или канцелярское искажение.