Фамилия Абзалеев — один из тех случаев, когда история происхождения читается почти без труда. В её основе лежит тюркское имя Абзал (встречаются варианты Абзали, Абзал), которое пришло из арабского языка и означает «самый уважаемый», «достойный», «превосходный». Имя было распространено в татарской и башкирской среде, поэтому и фамилия чаще всего встречается у этих народов, а также у других тюркских групп Поволжья и Приуралья.

Словообразовательная модель типична для XVI–XIX веков, когда народы, вошедшие в состав Российского государства, получали фамилии по русскому образцу. К тюркскому имени Абзал добавили русский патронимический суффикс -ев (фонетический вариант суффикса -ов после мягкого согласного). Буквально Абзалеев — это «сын Абзала» или «из рода Абзала». Такая конструкция — тюркское имя плюс русский суффикс — встречается у многих фамилий, образованных от личных имён.

В документах фамилия фиксируется в метрических книгах и ревизских сказках Оренбургской, Уфимской и Казанской губерний — именно там компактно жило тюркское население. В некоторых говорах встречается вариант Абзалиев, где сохраняется конечный «и» основы (имя произносили как Абзали). Однако в официальных бумагах закрепилась более краткая форма — Абзалеев.

Сословный состав носителей был неоднородным. Среди Абзалеев встречались и государственные крестьяне, и тептяри (особое сословие в Башкирии), и представители мусульманского духовенства. В советское время фамилия не исчезла, и сегодня её можно встретить не только в Башкортостане и Татарстане, но и в других регионах России, куда потомки переезжали в XX веке. Других версий происхождения, кроме арабско-тюркской, у этой фамилии нет — корень прозрачен и не даёт повода для споров.