Фамилия Афимин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Афимин послужило церковное имя Евфимий. Мужское имя Евфимий в переводе с греческого на русский язык означает «благожелательный». Это имя часто встречается в святцах (в истории православия известно около двадцати святых покровителей этого имени), а потому имя Евфимий, а также его краткий вариант Афима были весьма распространены на Руси. На Руси считалось, что если дать ребёнку имя святого или мученика, его жизнь будет благой и светлой, праведной, потому что существует незримая связь между именем и его святым покровителем. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Афима, со временем получил фамилию Афимин. О точном месте и времени возникновения фамилии Афимин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Афимин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.