Фамилия Афошин принадлежит к распространённому типу русских фамилий, образованных от крестильного имени с помощью суффикса -ин. В основе лежит каноническое имя Афанасий, которое в народной, бытовой речи часто сокращали и переиначивали. Уменьшительные формы Афоня, Афоша дали начало целому ряду фамилий: Афонин, Афоничев, Афонькин, Афошин. Суффикс -ин в данном случае указывает на принадлежность: «чей?» — Афошин, то есть сын или потомок Афоши.

Имя Афанасий (от греческого «афанатос» — бессмертный) было одним из самых популярных на Руси. Поэтому и фамилии от него встречаются повсеместно, но форма Афошин характерна для северных и центральных областей России, где особенно часто усекали полные имена. В писцовых книгах XVI–XVII веков можно найти упоминания крестьян и посадских людей с этим именем, что говорит о демократичном происхождении фамилии — её носили не только дворяне, но и простые сословия.

В отличие от фамилии Афонин, которая более массовая, Афошин встречается реже. Здесь сработал не просто суффикс, а конкретный вариант имени — Афоша, который мог быть не только ласкательным, но и прозвищным. В некоторых говорах «афошей» могли называть простоватого или рассеянного человека, но это вторичное значение, и основная масса носителей фамилии ведёт род от людей с именем Афанасий.

Интересно, что фамилия могла закрепиться и от географического названия: в Вологодской области есть деревня Афошино, а в Кировской — Афоничи. Жители таких мест нередко получали фамилию по названию деревни, а не напрямую от имени. В любом случае, Афошин — фамилия с ясным корнем, без тёмных мест: она прямо указывает на предка, которого в быту звали Афоша.