Фамилия Афутина — тот редкий случай, когда внешне простая основа скрывает неожиданный поворот. С точки зрения словообразования всё прозрачно: перед нами типичная «матрешечная» фамилия с суффиксом -ин, указывающим на принадлежность («чей?» — Афутин). Значит, в основе лежит личное имя или прозвище Афута. Но вот откуда взялось это Афута?

Самая вероятная версия — фонетическое искажение крестильного имени Афанасий. В русских говорах имя Афанасий сокращали до Афоня, Афонка, а в некоторых диалектах (особенно южнорусских и украинских) «ф» в начале слова переходило в «хв» или, наоборот, заменяло другие звуки. Форма «Афута» могла появиться через обратный процесс: от просторечного «Ахутя» (от Афанасий) с заменой «х» на «ф» под влиянием книжного произношения. В любом случае, Афута — это уменьшительная форма от Афанасий, что значит «бессмертный» (от греческого «афанатос»). Имя было настолько популярно на Руси, что его производные встречаются повсеместно, и Афутина — одна из таких живых записей народного произношения.

Менее распространённая, но не исключённая версия — связь с диалектным глаголом «афутеть», который в некоторых говорах значил «обмануть, провести» или «сильно удивиться». Прозвище Афута в таком случае мог получить хитрец или, наоборот, рассеянный человек. Однако эта гипотеза слаба: глагол редкий, а имя Афанасий было одним из самых частых, поэтому его производные встречаются гораздо чаще.

Географически фамилия Афутина тяготеет к югу России и Поволжью. Встречается в документах по Курской, Воронежской, Саратовской областям — как раз там, где диалектные формы имён с «ф» вместо «хв» и наоборот были нормой. В этих краях имя Афанасий в быту звучало как Апанас, Ахутя, Афуня, что косвенно подтверждает версию с Афанасием.

С социальной точки зрения фамилия однозначно крестьянская. Суффикс -in указывает на происхождение по отцу: «Афутин» — сын Афуты. Никакой связи с духовенством или дворянством нет. В XIX веке носители фамилии записаны как государственные или помещичьи крестьяне, реже — мещане.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Афонин, Афанасьев, Афонькин — показывает, что все они восходят к тому же имени, но Афутина стоит особняком из-за редкой фонетической адаптации. По сути, это не столько отдельная фамилия, сколько живая запись того, как в конкретной семье произносили имя предка.